El CITIC en la lucha contra el COVID-19

08/04/2020 - CITIC

La crisis sanitaria producida por el COVID-19 ha puesto de manifiesto la importancia de la investigación y las tecnologías de la información para encontrar soluciones para minimizar su impacto.

Desde el inicio de esta crisis, el CITIC ha puesto a disposición de las instituciones sus capacidades tanto tecnológicas como intelectuales para la implementación de medidas que permitan atajar la situación. Así, las cuatro áreas de investigación del centro (Inteligencia Artificial; Ciencia e Ingeniería de Datos; Computación de Altas Prestaciones; y Redes y Servicios Inteligentes) y todos los equipos de trabajo del CITIC se han unido en una colaboración enfocada ofrecer soluciones de valor para la sociedad.

 

ACCIONES

  • Ricardo Cao, nombrado presidente del comité de expertos de la iniciativa “Acción Matemática contra el Coronavirus”

El investigador del área de Ciencia e Ingeniería de Datos del CITIC y miembro del comité de dirección del centro, Ricardo Cao, ha sido nombrado por el Comité Español de Matemáticas (CEMat) presidente del comité de expertos de la iniciativa “Acción Matemática contra el Coronavirus”, que tiene el objetivo de ayudar al Gobierno de España a encontrar soluciones ante la crisis sanitaria originada por el virus COVID-19, aportando conclusiones y recomendaciones desde el ámbito de las matemáticas.

Este comité de expertos pondrá a disposición de las autoridades su capacidad de análisis y modelización para comprender el problema que está sufriendo nuestra sociedad con el COVID-19. A partir de los datos facilitados por el Gobierno sobre la evolución de la pandemia, microdatos de los casos diagnosticados, recursos disponibles, ficheros Big Data de movilidad, etc., el comité elaborará la modelización matemática de la pandemia para, a partir de ahí, establecer previsiones de evolución que permitirán la planificación óptima de los recursos.

Algunos impactos en medios de comunicación:

La Opinión de A Coruña

La Voz de Galicia

El Correo Gallego

GCiencia

 

  • Creación de una página web para monitorizar la evolución del COVID-19 en España

A partir del trabajo realizado por el investigador Rubén Fernández Casal, que comenzó a capturar los datos del Ministerio de Sanidad, Consumo y Bienestar del Gobierno de España relativos a los contagios por el COVID-19, Carlos Fernández Lozano, puso en marcha una página web que permite monitorizar la evolución del COVID-19 en España. Esta herramienta permite consultar los datos relativos al número de casos confirmados afectados por el COVID-19, filtrados por comunidades autónomas y por rangos de edad, así como los pacientes recuperados y los fallecimientos.

Esta iniciativa colaborativa cuenta con el respaldo del comité de expertos de la “Acción Matemática contra el Coronavirus” del Comité Español de Matemáticas (CEMat), que lanzó un llamamiento a la comunidad científica para participar en el proyecto, proponiendo un protocolo de actuación conjunta para que las personas que hubiesen realizado modelos predictivos de alguna variable (como número de ingresos en la UCI, número de hospitalizaciones, número de fallecimientos, etc.), volcasen los datos en un archivo conjunto de predicciones.

Así, la página web ya incluye predicciones de evolución, gracias a la participación de un grupo de más de 50 profesionales de la Estadística, Matemática y Ciencia de Datos de diferentes universidades españolas.

Algunos impactos en medios de comunicación:

Europa Press

20 Minutos

La Vanguardia

Televisión de Galicia

PROYECTOS

Convocatorias internacionales:

  • Proyecto Cooperative Forecasting: presentado a las COVID-19 Fast Grants. El objetivo de este proyecto es desarrollar una herramienta de predicción cooperativa para monitorizar y predecir la cifra de afectados y su tendencia durante las distintas fases de la epidemia. Esta predicción cooperativa o metapredictor utiliza distintas predicciones, realizadas con modelos y algoritmos diversos, para obtener una combinación optimizada de las predicciones, para las distintas comunidades autónomas y distintas variables (casos, ingresos hospitalarios, ingresos en UCI, fallecidos...).
  • Proyecto HospFastLearn: presentado a la convocatoria Fast Grants.
  • Proyecto CoDat (COVID-19 Database): presentando a la convocatoria H2020-SC1-PHE-CORONAVIRUS-2020-2D. Consiste en el desarrollo de una cohorte extensa de datos de la epidema de COVID-19.

 

Convocatorias nacionales:

  • Convocatoria para la financiación de proyectos de investigación sobre el SARS-COV-2 y la enfermedad COVID-19 del Instituto de Salud Carlos III

El CITIC ha presentado una propuesta a esta convocatoria en la que participan grupos de trabajo de diferentes áreas de investigación del centro, todos ellos dirigidos por el director del CITIC, Manuel F. González Penedo, y el investigador Ricardo Cao. La propuesta, con el título "Ciencia e ingeniería de datos para la evaluación, predicción poblacional y personalizada de la evolución de la enfermedad COVID-19", tiene como objetivo aportar conocimiento a corto plazo sobre la evolución de la enfermedad, así como aportar soluciones para un mejor manejo de la misma y su impacto en las personas.

 

Convocatorias regionales:

  • Llamada para identificar soluciones innovadoras que combatan el coronavirus COVID-19 de la Axencia Galega de Innovación (GAIN)
    • “Seguimiento del estado de salud de las personas mayores con tecnologías wearables para la detección temprana de contagio por COVID-19”. Investigadores: Carlos Dafonte y Javier Pereira.
    • “viaDBG: caracterización de cuasiespecies virales”. Investigadores: Susana Ladra y José Paramá.
    • “Miopía fase 2: Monitorización del impacto de la pandemia de COVID-19 en el estado anímico y la opinión pública de la sociedad digital”. Investigador: Jesús Vilares.
    • “DCOVID-19 (Drugs for COVID-19): Búsqueda teórica de fármacos o combinaciones de fármacos contra el COVID-19 usando química computacional, quimioinformática/bioinformática y Machine Learning con resultados open y privados en un portal web. Investigadores: Cristian Robert Munteanu.
    • “Herramienta de recogida de datos clínicos de pacientes para estudios asociados a riesgos patológicos”. Investigador: Marcos Ortega.
    • “Tecnologías basadas en técnicas de Deep Learning para cribado y granding automatizado de patologías en base a la imagen”. Investigador: Marcos Ortega.
    • “Herramienta automática para mejora de la eficacia de los test RT-PCR. Investigador: Marcos Ortega.
    • “COVIDLOC: Motor multitecnología para la localización de ciudadanos afectados por COVID-19. Investigadores: Luis Castedo, Carlos Escudero y José Antonio García Naya.
    • Herramienta para el diagnóstico del COVID-19: Proyecto centrado en el desarrollo de un sistema de test de detección de coronavirus en muestras de exudado nasofaríngeo y en plasma. El proyecto se basa en la utilización de la técnica de espectrometría de masas junto con técnicas de Inteligencia Artificial para clasificar pacientes en diferentes grados de afectación y realización de diagnóstico diferencial con otras patologías de debut similar al coronavirus.

Algunos impactos en medios de comunicación:

Código Cero

Cadena Ser (a partir del minuto 50:00)

Cadena Ser (a partir del minuto 47:00)

El Correo Gallego

 

Otras convocatorias:

  • Fondo Supera COVID-19 (CRUE – Banco Santander), se presentaron las siguientes propuestas:
    • Proyecto Cooperative Forecasting. Investigador: Ricardo Cao.
    • Proyecto HospFastLearn: En colaboración con las siguientes universidades: UCA (Cádiz), UCM (Complutense), UPC (Barcelona), US (Sevilla), USC, UVA (Valladolid), UVigo. Investigador: Ricardo Cao.
    • Propuesta Inteligencia Artificial aplicada a Microbiología y Clínica contra el coronavirus. Investigador: Marcos Ortega, en colaboración con el CHUAC, Televés y Universidad de Deusto.

 

  • Convocatoria de ayudas a equipos de investigación científica SARS-CoV-2 y COVID-19 de la Fundación BBVA
    • Proyecto sobre Identificación de factores neurooftalmológicos mediante métodos de Inteligencia Artificial para complicaciones vasculares a medio plazo en COVID-19. Investigador: Marcos Ortega, en colaboración con el Hospital Clínico San Carlos.

 

  • ​Proyecto puesto en marcha por la empresa pública Edar Bens sobre el análisis de la carga viral presente en las aguas residuales del área metropolitana de A Coruña

Los investigadores del CITIC Ricardo Cao y Susana Ladra participan en un proyecto para la monitorización del estado de las aguas residuales y lodos de la depuradora de Bens (A Coruña). Gracias al análisis de la carga viral del SARS-CoV-2 presente en estas aguas se podrá conocer el estado epidemiológico en general. El proyecto está comandado por Margarita Poza, investigadora del Grupo de Microbiología del Instituto de Investigación Biomédica de A Coruña (INIBIC).

A la estación depuradora (Edar) de Bens llegan residuos de cinco ayuntamientos (A Coruña, Arteixo, Cambre, Culleredo y Oleiros), por lo que los datos que se recaben procederán de un universo muestral de 450.000 personas, además de abarcar cuatro hospitales.

Esta monitorización servirá también para predecir posibles brotes futuros y hacer comparativas entre distintas poblaciones y áreas geográficas. Además, este estudio podrá dar pistas sobre cómo mejorar el tratamiento de las aguas residuales para devolverlas al mar con la menor carga viral posible y evitar la propagación ambiental del virus. Así, el carácter del proyecto no es solo epidemiológico, sino también ecológico.

El estudio ha determinado que, si bien llega material genético del virus a la planta, este se elimina antes de su salida al mar, por lo que queda descartada su diseminación ambiental en la costa coruñesa.

Algunos impactos en medios de comunicación:

ABC

Televisión de Galicia

GCiencia

Eco Dixital

 

Otras iniciativas (colaboraciones e investigaciones incipientes)

  • Propuesta metodológica del CEMat para el diseño muestral del estudio de seroprevalancia como el que está llevando a cabo el Centro Nacional de Epidemioloxía junto con el Instituto Nacional de Estadística. Investigadora: María José Lombardía.
  • Estimación de tiempos relevantes de hospitalización en pacientes de COVID-19 en Galicia. Investigadoras: Amalia Jácome, Ana López Cheda, Wende Safari y Rebeca Peláez.
  • Predicción diaria, a una semana vista, de la epidemia en Galicia para la Dirección Xeral de Saúde Pública durante la fase más intensa de la epidemia. Investiadores:  Juan Manuel Vilar, Germán Aneiros y Graciela Estévez.
  • Modelización espacio-temporal e inferencia en áreas pequeñas para la previsión de rebrotes en Galicia a partir de datos de pacientes y de mobilidade. Investigadores: Mario Francisco Fernández, Rubén Fernández Casal, María José Lombardía, Nieves Brisaboa, Miguel Luaces y Susana Ladra, así como investigadores de la USC, UVigo, UJI, UNavarra y del Instituto Galego de Estatística. 
  • Sistema de cribado de COVID vs sano vs otras patologías en base a radiografía. Se está colaborando con los servicios de radiología e informática del CHUAC para tratar de integrar este sistema en el hospital para estar preparados en caso de rebrote de la enfermedad. El servicio tiene una ventaja fundamental frente a otras alternativas similares, ya que tiene la capacidad de detectar y funcionar a diferentes calidades de imagen y dispositivos. Investigador: Marcos Ortega.

 

INICIATIVAS SOLIDARIAS

De forma complementaria, además de proyectos de investigación, otros integrantes del CITIC están llevando a cabo iniciativas para la colaboración con sectores claves en esta crisis y con algunos de los colectivos que se están viendo más perjudicados.

  • Teleformación en colaboración con entidades sin ánimo de lucro

En esta línea, la investigadora del área de Inteligencia Artificial Thais Pousada está ofreciendo teleformación, a través de webinars, en colaboración con diferentes entidades sin ánimo de lucro (la ONG Mestura, la Federación Española de Enfermedades Raras y Duchenne Parent Project España). También impartió un webinar en la plataforma Miríadax sobre “Cuidado del propio cuerpo: Consejos para una buena higiene postural”, enmarcado en el ciclo de sesiones #YoMeQuedoEnCasa promovido por la plataforma, y la ponencia “Entendiendo la Estadística: Aplicación a Terapia Ocupacional” organizada por el Colegio de Terapeutas Ocupacionales de Galicia (COTOGA). Asimismo, participó en una reunión de la Rehabilitation Engineering and Assistive Technology Society of North America (RESNA) con la ponencia “AT provision in the time of COVID-19”.

 

  • Donación de máscaras realizadas con impresora 3D

Además, alineada con la iniciativa Coronavirus Makers Galicia, Thais Pousada está utilizando su impresora 3D para realizar viseras de pantallas de protección individual. Aparte del modelo facilitado por la comunidad Coronavirus Makers Galicia, Thais Pousada realizó un diseño propio, basado en el anterior, con materiales termoplásticos y foam.

 

El responsable del área de sistemas del CITIC, Alejandro Mosteiro, también está utilizando la impresora 3D del centro con este objetivo. Ya ha realizado la primera entrega de material en el centro logístico que se encarga de la distribución a los centros adheridos a la iniciativa (personal sanitario, colectivos vulnerables, fuerzas del orden, personal de farmacias y personal expuesto cara al público).

Algunos impactos en medios de comunicación:

Cadena Ser (a partir del minuto 46:06)

 

  • Donación de pantallas pediátriacas a ASPACE Coruña

El CITIC ha donado un lote de pantallas pediátricas de protección individual destinadas a los usuarios de ASPACE Coruña. La entrega se realizó al fisioterapeuta de ASPACE Coruña, Rubén Carneiro, por parte del director del CITIC, Manuel F. González Penedo, el subdirector, Javier Pereira, y el responsable de la unidad de sistemas, Alejandro Mosteiro.

Las pantallas han sido fabricadas con la impresora 3D del CITIC y serán utilizadas por los usuarios del centro educativo de ASPACE Coruña, niños y jóvenes de edades comprendidas entre los 3 y los 21 años, y del centro de atención temprana, que atiende a niños de hasta 6 años.

 

  • Ricardo Cao participó en la Jornada de Investigación Matemática en tiempos de COVID

El pasado miércoles 10 de junio, Ricardo Cao participó en la Jornada de Investigación Matemática en tiempos de COVID, como presidente del comité de expertos de la Acción Matemática contra el Coronavirus. La jornada estuvo organizada por el Instituto Andaluz de Matemáticas (IAMAT) en su sede en la UGR, el IEMath-GR, y contó con diversos investigadores en Estadística, Matemáticas y Ciencias de la Computación que compartieron sus últimos trabajos relacionados con la pandemia.

 

  • Organización de #HACKatHOME

El CITIC colabora en la organización de #HACKatHOME, el primer hackathon 100 % virtual de Galicia, que se celebra del 27 al 30 de junio. El objetivo de este encuentro es crear soluciones innovadoras en Galicia para adaptar el tejido empresarial a una nueva realidad tras la crisis sanitaria. #HACKatHOME involucra a empresas tecnológicas, universidades y personas de diferentes ámbitos para construir soluciones tanto físicas como digitales para cinco de los grandes retos de la industria, el comercio y el empleo. Los proyectos serán valorados por un comité de expertos, del que forman parte representantes del CITIC.

Algunos impactos en medios de comunicación:

Código Cero